┌兎形目(Lagomorpha)　
┤│┌──────────ナキウサギ科(Ochotonidae)
│└┤　　　　　　　　　　└ナキウサギ Ochotona princeps　
│　└──────────ウサギ科(Leporidae)
│　　　　　　　　　　　　└アナウサギ Oryctolagus cuniculus
└齧歯目(Rodentia)
　│┌ハツカネズミ関連系統群(Mouse-related clade)
　│││┌─ビーバー形亜目(Castrimporpha)
　││││　│┌─────ビーバー科(Castoridae)
　││││　└┤　　　　　└アメリカビーバー Castor canadensis 　
　││└┤　　│┌────ポケットマウス科(Heteromyidae)
　││　│　　└┤　　　　└ハーマンカンガルーネズミ Dipodomys heermanni
　││　│　　　└────ホリネズミ科(Geomyidae)
　└┤　│　　　　　　　　└キガオホリネズミ Cratogeomys castanops
　　│　│┌ウロコオリス形亜目(Anomaluromorpha)
　　│　│││┌─────ウロコオリス科(Anomaluridae)
　　│　└┤└┤　　　　　└ビークロフトウロコオリス Anomalurus beecrofti
　　│　　│　└─────トビウサギ科(Pedetidae)
　　│　　│　　　　　　　└トビウサギPedetes capensis　
　　│　　└ネズミ形亜目(Myomorpha)　
　　│　　　│┌─────トビネズミ科(Dipodidae)
　　│　　　└┤　　　　　└ヒメミユビトビネズミ Jaculus jaculus
　　│　　　　│┌────トゲヤマネ科(Platacanthomidae)
　　│　　　　└┤　　　　└ホソオトゲヤマネ Typhlomys cinereus
　　│　　　　　│┌───メクラネズミ科(Spalacudae)
　　│　　　　　└┤　　　└シリアヒメメクラネズミSpalax ehrenbergi
　　│　　　　　　│┌──カンガルーハムスター科(Calomyscidae)
　　│　　　　　　└┤　　└カンガルーハムスター Calomyscus bailwardi
　　│　　　　　　　│┌─ネズミ科(Muridae)
　　│　　　　　　　└┤　└ダイコクネズミ Rattus norvegicus
　　│　　　　　　　　│┌マダガスカルネズミ科(Nesomyidae)
　　│　　　　　　　　└┤└サバンナアフリカオニネズミ Cricetomys gambianus
　　│　　　　　　　　　└キヌゲネズミ科(Cricetidae)
　　│　　　　　　　　　　└バラブキヌゲネズミ Cricetulus barabensis
　　│┌リス関連系統群(Squirrel-related clade)
　　││└───リス形亜目(Sciuromorpha)
　　││　　　　│┌───ヤマネ科(Gliroidae)　
　　└┤　　　　└┤　　　└アフリカヤマネ Graphiurus murinus
　　　│　　　　　│┌──ヤマビーバー科(Aplodontidae)
　　　│　　　　　└┤　　└ヤマビーバー Aplodontia rufa
　　　│　　　　　　└──リス科(Sciuridae)　
　　　│　　　　　　　　　└ジュウサンセンジリス Ictidomys tridecemlineatus
　　　└テンジクネズミ関連系統群(Cavy-related clade)
　　　　│┌──ヤマアラシ亜目(Ctenohystrica = Hystricomorpha)
　　　　││　　│┌───ディアトミス科(Diatomyidae)
　　　　││　　└┤　　　└ラオスイワネズミ Laonastes aenigmamus
　　　　└┤　　　└───グンディ科(Ctenodactylidae)
　　　　　│　　　　　　　└アトラスグンディ Ctenodactylus gundi　
　　　　　│┌─ヤマアラシ顎亜目(Hystricognathi)
　　　　　││　└────ヤマアラシ科(Hystricidae)　
　　　　　└┤　　　　　　└マレーヤマアラシ Hystrix brachyura
　　　　　　│┌フィオミス小目(Phiomorpha)
　　　　　　│││　┌──アフリカイワネズミ科(Petromuridae)
　　　　　　└┤│┌┤　　└アフリカイワネズミ Petromus typicus
　　　　　　　│││└──ヨシネズミ科(Thryonomyidae)
　　　　　　　│└┤　　　└ヨシネズミ Thryonomys swinderianus
　　　　　　　│　│┌──デバネズミ科(Bathyergidae)
　　　　　　　│　└┤　　└ダマラデバネズミ Fukomys damarensis
　　　　　┌─┘　　└──ハダカデバネズミ科(Heterocephalidae)
　　　　　│　　　　　　　└ハダカデバネズミ Heterocephalus glaber　
　　　　　└テンジクネズミ小目(Caviomorpha)
　　　　　　│　┌────アメリカヤマアラシ科(Erethizontidae)
　　　　　　│┌┤　　　　└カナダヤマアラシ Erethizon dorsatum　
　　　　　　│││┌───パカ科(Cuniculidae)　
　　　　　　││└┤　　　└ヤマパカ Cuniculus taczanowskii
　　　　　　└┤　│┌──テンジクネズミ科(Caviidae)
　　　　　　　│　└┤　　└テンジクネズミ Cavia porcellus　
　　　　　　　│　　└──アグーチ科(Dasyproctidae) Cavia porcellus　
　　　　　　　│　　　　　└マダラアグーチ Dasyprocta punctata
　　　　　　　│　┌───パカラナ科(Dinomiydae)
　　　　　　　│┌┤　　　└パカラナ Dinomys branickii　
　　　　　　　││└───チンチラ科(Chinchillidae)　
　　　　　　　└┤　　　　└オナガチンチラ Chinchilla lanigera
　　　　　　　　│┌───チンチラネズミ科(Abrocomidae)
　　　　　　　　││　　　└ベネットチンチラネズミ Abrocoma bennettii
　　　　　　　　└┤　┌─デグー科(Octodontidae)
　　　　　　　　　│┌┤　└デグー Octodon degus　
　　　　　　　　　││└─ツコツコ科(Ctenomyidae)
　　　　　　　　　└┤　　└ボリビアツコツコ Ctenomys boliviensis
　　　　　　　　　　│┌─フチア科(Capromyidae)
　　　　　　　　　　└┤　　└デマレフチア Capromys pilorides
　　　　　　　　　　　│┌アメリカトゲネズミ科(Echimyidae)
　　　　　　　　　　　└┤└ヨロイトゲネズミ Hoplomys gymnurus
　　　　　　　　　　　　└ヌートリア科(Myocastoridae)
　　　　　　　　　　　　　└ヌートリア Myocastor coypus

グリレス大目(Glires)
└┬兎形目(Lagomorpha)：ウサギ
　└齧歯目(Rodentia)：ネズミ
　　│┌リス形亜目(Sciuromorpha)
　　││├リス上科(Sciuridea)
　　│││└┬リス科(Sciuridae)
　　│││　└ヤマビーバー科(Aplodontidae)
　　││└ヤマネ科(Griridae)
　　││　　┌ネズミ型亜目(Myomorpha)
　　└┤　┌┤└┬トビネズミ科(Dipodidae)
　　　│　││　└┬メクラネズミ科(Spalacidae)
　　　│┌┤│　　└┬キヌゲネズミ科(Cricetidae)
　　　││││　　　└ネズミ科(Muridae)
　　　│││└ウロコオリス形亜目(Anomaluromorpha)
　　　└┤│　└┬ウロコオリス科(Anomaluridae)
　　　　││　　└トビウサギ科(Pedetidea)
　　　　│└ビーバー形亜目(Castorimorpha)
　　　　│　└┬ビーバー科(Castoridae)
　　　　│　　└┬ホリネズミ科(Geomyidae)
　　　　│　　　└ポケットマウス科(Heteromyidae)
　　　　└ヤマアラシ形亜目(Hystricomorpha)
　　　　　　└┬グンディ科(Ctenodactylidae)
　　　　　　　└ヤマアラシ亜目(Hystricognathii)
　　　　　　　　└┬ヤマアラシ科(Hystricidae)
　　　　　　　　　│┌┬デバネズミ科(Bathyergidae)
　　　　　　　　　└┤└┬アフリカイワネズミ科(Petromuridae)
　　　　　　　　　　│　└ヨシネズミ科(Thryonomyidae)
　　　　　　　　　　└テンジクネズミ形類(Caciomorpha)
　　　　　　　　　　　└┬┬テンジクネズミ科(Caviideae)
　　　　　　　　　　　　│└アメリカヤマアラシ科(Erethizontidae)
　　　　　　　　　　　　└┬チンチラ科(Chinchillidae)
　　　　　　　　　　　　　└デグー上科(Octodontoidea)