┌クレード1 (Clade1)
││　　　　　┌ナンカイギボウシ Hosta tardiva subsp. tardiva
││　　　┌┬┴スダレギボウシ Hosta tardiva subsp. densinervia
┤│　　┌┤└オクスダレギボウシ Hosta polyneronoides【新記載種】
││　┌┤└ザラツキギボウシ Hosta scabrinervia
││┌┤└サムカゼギボウシ Hosta samukazemontana【新記載種】
││││┌Hosta sp. 3
│││└┤┌ミナヅキギボウシ Hosta minazukiflora【新記載種】
│└┤　└┴┬シコクホキボウシ1 Hosta shikokiana 2
│　│　　　└シコクホキボウシ2 Hosta shikokiana 1
│　│┌カムロギボウシ Hosta longipedicallata【新記載種】
│　└┴┬タキミナヅキギボウシ Hosta takiminazukiflora subsp. takiminazukiflora【新記載種】
│　　　└セトガワギボウシ Hosta takiminazukiflora subsp. grandis【新記載亜種】
├クレード2 (Clade2)
│└ヒメイワギボウシ Hosta gracillima
├クレード3 (Clade3)
││┌┬Hosta sp. 1
│└┤└┬ブンゴギボウシ Hosta alata
│　│　└ウバタケギボウシ Hosta pulchella
│　└┬ヒュウガギボウシ Hosta kikuchii
│　　└┬Hosta sp. 2
│　　　└サイコクイワギボウシ Hosta longipes var. caduca
└┬クレード4 (Clade4)
　│└┬トサノギボウシ Hosta tosana var. caput-avis
　│　└トサノギボウシ Hosta tosana Kagami Rver lineage
　│┌クレード5 (Clade5)
　└┤└オヒガンギボウシ Hosta aequinoctiiantha
　　└クレード6 (Clade6)
　　　│　　┌Hosta sp. 4
　　　│　┌┴┬イワギボウシ Hosta longipes var. longipes
　　　│┌┤　└イズイワギボウシ Hosta longipes var. latifolia
　　　││└オオバギボウシ Hosta sieboldiana　
　　　└┤　┌ナガサキキボウシ Hosta tibae
　　　　│┌┼カンザシギボウシ Hosta cpitata
　　　　└┤└ツシマギボウシ Hosta tsushimensis
　　　　　│┌┬バランギボウシ Hosta alismifolia
　　　　　└┤└ミズギボウシ Hosta lonissima
　　　　　　└┬トウギボウシ Hosta seiboldiana X seiboldii
　　　　　　　└コバギボウシ Hosta seiboldii