植物界の系統概要と当ブログでの収録数

 以前に作図した系統図より、単純化されて緑藻類の基部が分かりやすくなった現在の植物界全体の系統図(Leebens-Mack et al.,2019)を見つけましたので、和訳再録しておきます。併せて、現時点での当ブログでの収録種数を、維管束植物について数えてみました。一部亜種を含む数なので、記載種約30万に対する当ブログでの収録種数は約2000種(0.6%)といったところです。
 維管束植物の分類【陸上植物小葉植物と大葉シダ植物裸子植物被子植物(APG-IV体系)】【生物系統樹


【植物界の系統推定図】(Leebens-Mack et al.,2019)

            ┌被子植物(Angiospermae)
            ││             ┌コア・バラ目群(Core rosids)
            ││            ┌┴ユキノシタ目(Saxifragales)
            ││           ┌┴ブドウ目(Vitales)      │
            ││          ┌┴ビャクダン目(Santalales)    │
            ││         ┌┤ ┌キク目群(Asterids)      │
            ││         │└┬┴ベルベリドプシス目      ┝真正双子葉類 
            ││         │ │  (Berberidopsidales)    │ (Eudicots)
            ││         │ └ナデシコ目(Caryophyllales)   │
            ││        ┌┴グンネラ/ビワモドキ        │
            ││        │  (Gunnera and Dillenia)      │
            ││       ┌┴ツゲ/ヤマグルマ           │
            ││       │  (Buxus and Trochodendron)     │
            ││      ┌┴ヤマモガシ目(Proteales)        │
            ││     ┌┴キンポウゲ類(Ranunculids)        ┘
            ││    ┌┴マツモ(Ceratophyllum demersum)
            ││   ┌┴モクレン目群/センリョウ目(Magnoliids and Chloranthales)
            ││   │   ┌ユリ目/キジカクシ目     ┐
            ││   │   │ (Liliales and Asparagales) │
            ││   │  ┌┴ツユクサ目群(Commelinids)  │
            ││  ┌┤ ┌┴ヤマノイモ目/タコノキ目    ┝単子葉類
            ││  ││ │  (Dioscoreales and Pandanales)│(Monocots)
            ││  │└┬┴オモダカ目(Alismatales)     │
            ││ ┌┤ └ショウブ(Acorus americanus)    ┘
            ││┌┤└アウストロバイレヤ目(Austrobaileyales)
           ┌┤└┤└スイレン目(Nymphaeales)          ┝ANA側系統群
           ││ └アンボレラ属(Amborella)          ┘(ANA grade)
           │└裸子植物(Gymnosperms)
           │ │   ┌ヒノキ目(Cupressales)
          ┌┤ │  ┌┴ナンヨウスギ目(Araucariales)
          ││ │ ┌┴マツ科(Pinaceae)
         ┌┤│ │┌┴グネツム目(Gnetales)
         │││ └┴ソテツ類/イチョウ(Cycads and Ginkgo)
         ││└大葉シダ類(Ferns)
        ┌┤│ │  ┌ウラボシ亜綱(Polypodiidae)
        │││ │ ┌┴リュウビンタイ亜綱(Marattiidae)
        │││ │┌┴ハナヤスリ亜綱(Ophioglossidae)
        │││ └┴トクサ亜綱(Equisetidae)
        ││└小葉植物(Lycophytes)
        │└コケ植物(Bryophytes)
        │ │ ┌蘚類(Mosses)
       ┌┤ │┌┴苔類(Liverworts)
      ┌┤│ └┴ツノゴケ類(Hornworts)
      ││└接合藻綱(Zygnematophyceae)       ┐
     ┌┤└コレオケーテ藻綱(Coleochaetales)     │
    ┌┤└シャジクモ属(Chara)             ┝ストレプト藻側系統群
    │└クレブソルミジウム目(Klebsormidiales)     │(Streptophyte algae grade)
   ┌┤ ┌スピロテニア・ミヌタ(Spirotaenia minuta)  │
   │└┬┴クロロキブス・アトモフィティクス      │
   │ │ (Chlorokybus atmophyticus)         │
  ┌┤ └メソスティグマ・ビリデ(Mesostigma viride)   ┘
 ┌┤└┬プラシノ藻目(Prasinococcales)          ┐緑藻側系統群
┌┤│ └緑藻植物(Chlorophyta)              ┴(Chlorophyte algae grade)
┤│└灰色植物(Glaucophytes)
│└紅色植物(Rhodophytes)
└外群(Outgroup)


注:側系統群(grade)は、現在の知見では多系と考えられていて従来体系との繋がりを確保するために階級を設定せずに仮置きされているグループで『段階群』の訳語もあります。一方、クレード(clade)は単系統であることは確認されていても階級が定められていないグループで訳語は『分岐群』です。グレードをクレードに置き換えていくのが、現在の分子系統整理の目的の一つとなっており、近年ではかつての『門』『綱』などの分類階級はあまり重視されなくなりつつあるようです。例えば、被子植物の分類体系であるAPG(Angiosperm Phylogeny Group)分類では、綱を設定せずに綱相当以上の高位群はすべてクレードまたはグレードとして扱っています。


【維管束植物の収録割合】2024-09-14時点

分類群(Taxon)
(Order)

(Family)

(Genus)
種(亜種)
(Species)
維管束植物計 70 (82%) 233 (48%) 1099 (8.1%) 2141 (0.69%)
被子植物 50 (78%) 196 (47%) 1014 (7.7%) 2004 (0.68%)
裸子植物 7 (100%) 12 (100%) 40 (48%) 67 (6.2%)
大葉シダ 11 (100%) 23 (48%) 42 (13%) 61 (0.58%)
小葉植物 2 (67%) 2 (50%) 3 (17%) 9 (0.67%)

カッコ内の%値は、全記載数(推定値)に対する割合です。


【文献】
One Thousand Plant Transcriptomes Initiative (Leebens-Mack JH, Barker MS, Carpenter EJ, Deyholos MK, Gitzendanner MA, Graham SW, Grosse I, Li Z, Melkonian M, Mirarab S, Porsch M, Quint M, Rensing SA, Soltis DE, Soltis PS, Dennis W. Stevenson DW, Ullrich KK, Wickett NJ, DeGironimo L, Edger PP, Jordon-Thaden IE, Joya S, Liu T, Melkonian B, Miles NW, Pokorny L, Quigley C, Thomas P, Villarreal JC, Augustin MM, Barrett MD, Baucom RS, Beerling DJ, Benstein RM, Biffin E, Brockington SF, Burge DO, Burris JN, Burris KP, Burtet-Sarramegna V, Caicedo AL, Cannon SB, Çebi Z, Chang Y, Chater C, Cheeseman JM, Chen T, Clarke ND, Clayton H, Covshoff S, Crandall-Stotler BJ, Cross H, dePamphilis CW, Der JP, Determann R, Dickson RC, Stilio Shona Ellis S, Fast E, Nicole Feja N, Field KJ, Filatov DA, Finnegan PM, Floyd SK, Fogliani B, García N, Gâteblé G, Godden GT, Goh F(QU), Greiner S, Harkess A, Heaney JM, Helliwell KE, Heyduk K, Hibberd JM, Hodel RGJ, Hollingsworth PM, Johnson MTJ, Jost R, Joyce B, Kapralov MV, Kazamia E, Kellogg EA, Koch MA, Konrat MV, Könyves K, Kutchan TM, Lam V, Larsson A, Leitch AR, Lentz R, Li F-W, Lowe AJ, Ludwig M, Manos PS, Mavrodiev E, McCormick MK, McKain M, McLellan T, McNeal JR, Miller RE, Nelson MN, Peng Y, Ralph P, Real D, Riggins CW, Ruhsam M, Sage RF, Sakai AK, Scascitella M, Schilling EE, Schlösser E-M, Sederoff H, Servick S, Sessa EB, Shaw AJ, Shaw SW, Sigel EM, Skema C, Smith AG, Smithson A, Stewart JrCN, Stinchcombe JR, Szövényi P, Tate JA, Tiebel H, Trapnell D, Villegente M, Wang C-N, Weller SG, Wenzel M, Weststrand S, Westwood JH, Whigham DF, Wu S, Wulff AS, Yang Y, Zhu D, Zhuang C, Zuidof J, Chase MW, Pires JC, Rothfels CJ, Yu J, Chen C, Chen L, Cheng S, Li J, Li R, Li X, Lu H, Ou Y, Sun X, Tan X, Tang J, Tian Z, Wang F, Wang J, Wei X, Xu X, Yan Z, Yang F, Zhong X, Zhou F, Zhu Y, Zhang Y, Ayyampalayam S, Barkman TJ, Nguyen N-P, Matasci N, Nelson DR, Sayyari E, Wafula EK, Walls RL, Warnow T, An H, Arrigo N, Baniaga AE, Sally Galuska S, Jorgensen SA, Kidder TI, Kong H, Lu-Irving P, Marx HE, Qi X, Reardon CR, Sutherland BL, Tiley GP, Welles SR, Yu R, Zhan S, Gramzow L, Theißen G and Wong GK-S (2019) One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants, Nature, 574(31), 679-685, DOI: 10.1038/s41586-019-1693-2, Accessed: 2024-07-29.
The Angiosperm Phylogeny Group and others (2016) An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV, Botanical Journal of the Linnean Society, 181(1), 1–20, DOI: 10.1111/boj.12385, Accessed: 2023-07-07.
Pteridophyte Phylogeny Group (2016) A Community-derived Classification for Extant Lycophytes and ferns, J System Evol, 54(6), 563–603, DOI: 10.1111/jse.12229, Accessed: 2023-11-19.
Christenhusz MJM and Byng JW (2016) The number of known plants species in the world and its annual increase, Phytotaxa. 261(3), 201–217. DOI: 10.11646/phytotaxa.261.3.1, Accessed: 2023-10-05.

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