┌肉鰭類(Actinistia)：シーラカンス属(Latimeria)　　┐
┤　┌ハイギョ下綱(Dipnoi)　　　　　　　　　　　　 │
│┌┤│┌┬オーストラリアハイギョ属(Neoceratodus) ├魚類
└┤│└┤└プロトプテルス属(Protopterus)　　　 　 │
　││　└┬キロディプテルス属(Chirodipterus)(†)　│
　││　　└グリフォグナトゥス属(Griphognathus)(†)│
　│└グリプトレピス属(Glyptolepis)(†)　　　　　　┘
　└┬グールゴンギア属(Gooloogongia))(†)　　　 ┐
　　└┬エウステノプテロン属(Eusthenopteron)(†)├四足形類
　　　└┬ティクターリク属(Tikaalik)(†)　　　　┘(Tetrapodomorph fish)
　　　　│┌アカントステガ属(Acanthostega)(†)　　　　┐
　　　　│├イクチオステガ属(Ichthyostega)(†)　　　　│
　　　　└┤┌チュレルペトン属(Tulerpeton)(†)　　　　│
　　　　　└┤┌オッシノダス属(Ossinodus)(†)　　　　 │
　　　　　　├┼ワトケエリア属(Wgatcheeria)(†)　　　 ├ステム四肢動物
　　　　　　│└ペデルペス属(Pederpes)(†)　　　　　　│(Stem Tetrapoda)
　　　　　　└┬クラッシギリヌス属(Crassigyrinus)(†) │
　　　　　　　└┬グリーレルペトン属(Greererpeton)(†)│
　　　　　　　　└┬バフェテス属(Baphetes)(†)　　　　┘
　　　　　　　　　│　┌エリオプス属(Eryops)(†)
　　　　　　　　　│┌┤┌サラマンドラ属(Salamandra)　　　　┬平滑両生類
　　　　　　　　　└┤└┴トラフサンショウウオ属(Ambystoma) ┘(Lissamphibia)
　　　　　　　　　　│　┌エオヘルペトン属(Eoherpeton)(†)
　　　　　　　　　　│┌┤┌アルケリア属(Archeria)(†)
　　　　　　　　　　└┤└┴プロテロギリヌス属(Proterogyrimus)(†)
　　　　　　　　　　　│┌カプトリヌス属(Captorhinus)┐
　　　　　　　　　　　└┤┌ムカシトカゲ属(Sphenodon)├有羊膜類 →
　　　　　　　　　　　　└┴イグアナ属(Iguana)　　　 ┘(Amniota)

　┌主竜形類(Archosaeromorpha)
┌┤└┬カメ目(Testudines)
┤│　└┬ワニ目(Crocodylia)
││　　└鳥綱(Aves)
│└鱗竜形類(Lepidosauromorpha)
│　└┬ムカシトカゲ目(Rhyncocephalia)
│　　└有鱗目(Squamata)
└哺乳綱(Mammalia)

┌爬虫綱(Reptilia)
┤└┬無弓類(Anapsida)
│　│└┬カメ目(Testudines)：現生種を含む
│　│　└カプトリヌス科(Captorhinidae)
│　└双弓類(Diapsida)
│　　└┬鱗竜形類(Lepidosauromorpha)
│　　　└有隣目(Sauria)：現生種を含む
│　　　　└主竜形類(Archosauromorpha)
│　　　　　└┬リンコサウルス目(Rhynchosauria)
│　　　　　　└┬トリオフォサウルス属(Triophosaurus)
│　　　　　　　└┬コリストデラ目(Choristoderia)
│　　　　　　　　└┬プロラケルタ目(Protorosauria)
│　　　　　　　　　└┬アルケオサウリフォルメス類(Archeosauriformes)
│　　　　　　　　　　└┬プロテロスクス科(Proterosuchidae)
│　　　　　　　　　　　└┬エリスロスクス科(Erythrosuchidae)
│　　　　　　　　　　　　└┬プロテロチャンプ科(Proterochampsidae)
│　　　　　　　　　　　　　└主竜類(Archosauria)
│　　　　　　　　　　　　　　│：現在は鳥類(Aves)、恐竜類、翼竜類を含む
│　　　　　　　　　　　　　　└┬偽鰐類(Pseudosauria)
│　　　　　　　　　　　　　　　└オルニトスクス科(Ornithosuchia)
└単弓類(Synapsid)
　└┬カセア属(Casea)
　　└┬オフィアコドン属(Ophiacodon)
　　　└┬エダフォサウルス属(Edaphosaurus)
　　　　└┬スフェナコドン科(Sphenacodontia)
　　　　　│└スフェナコドン亜科(Sphenacodontinae)
　　　　　└獣弓類(Therapsida)
　　　　　　└┬ビアルモスクス亜目(Biarmosuchia)
　　　　　　　└┬ディノケファルス亜目(Dinocephalia)
　　　　　　　　└┬ゴルゴノプス亜目(Gorgonopsida)
　　　　　　　　　└┬ディキノドン下目 (Dicynodontia)
　　　　　　　　　　└真正獣歯類(Eutheriodontia)
　　　　　　　　　　　└┬テロケファルス亜目(Therocephalia)
　　　　　　　　　　　　└キノドン類(Cynodontia)
　　　　　　　　　　　　　└┬プロキノスクス属(Procynosuchus)
　　　　　　　　　　　　　　└┬トリナクソドン属(Thrinaxodon)
　　　　　　　　　　　　　　　└┬ディアデモドン属(Diademodon)
　　　　　　　　　　　　　　　　└┬エクサエレトドン属(Exaeretodon)
　　　　　　　　　　　　　　　　　└┬マンマリアモルファ類(Mammaliamorpha)
　　　　　　　　　　　　　　　　　　└┬トリテロドン科(Tritylodontidae)
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　└┬哺乳形類(Mammaliaformes)
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　└┬モルガヌコドン目(Morganucodontidae)
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　└哺乳綱(Mammalia))：現生種を含む

┌トリメロラキス属(Trimerorhachis)(†)
┤┌スクレロケファルス属(Sclerocephalus)(†)
│├アカンソストマトプス属(Acanthostomatops)(†)
└┤┌ペリーエラ属(Perryella)(†)
　└┤┌マイクロメレルペトン科(Micromelerpetidae)
　　│││┌マイクロメレルペトン属(Micromelerpeton)(†)
　　││└┤┌エイメリサウルス属(Eimerisaurus)(†)
　　││　└┼ブランキエルペトン属(Branchierpeton)(†)
　　└┤　　└リモギリヌス属(Limnogyrinus)(†)
　　　│┌オルソニフォルメス類(Olsoniformes)
　　　││├ディッソロフス科(Dossorophidae)
　　　└┤││┌┬カコプス属(Cacops)(†)
　　　　││└┤└コンジュンクティオ属(Conjunctio)(†)
　　　　││　└┬ブロイリエルス属(Broiliellus)(†)
　　　　││　　└ディッソロフス属(Dissorophus)(†)
　　　　│└トレマトプス科(Trematopidae)
　　　　│　│┌フェードキア属(Fedoxia)(†)
　　　　│　└┼エコルソニア属(Ecolsonia)(†)
　　　　│　　└┬フォネルペトン(Phonerpeton)(†)
　　　　│　　　└アケロマ属(Acheloma)(†)
　　　　└アムフィバムス科(Amphibamidae)
　　　　　│┌プラティリノプス属(Platyrhinops)(†)
　　　　　│├エオスコプス属(Eoscopus)(†)
　　　　　││┌テルソミウス属(Tersomius)(†)
　　　　　│├┤┌パソウウィオープス属(Pasawioops)(†)
　　　　　└┤└┴マイクロフォリス属(Micropholis)(†)
　　　　　　│┌┬アンフィバムス属(Amphibamus)(†)
　　　　　　││└ドロセルペトン属(Doleserpeton)(†)
　　　　　　││┌ゲロバトラクス属(Gerobatrachus)(†)
　　　　　　││├(ゲオルゲンタリア属Georgenthalia)
　　　　　　└┤│┌エオカエキリア属(Eocaecilia)(†)
　　　　　　　│├┤┌カラウルス属(Karaurus)(†)
　　　　　　　└┤└┴トリアドバトラクス属(Triadobatrachus)(†)
　　　　　　　　└平滑両生類(Lissamphibia)：現生種を含む ─→
　　　　　　 　　　│┌ブランキオサウルス属(Branchiosaurus)(†)
　　　　　　 　　　│├アパテオン属(Apateon)(†)
　　　　　　 　　　└┤┌レプトロプス属(Leptorophus)(†)
　　　　　　 　　　　└┴スコエンフェルデルペトン属(Schoenfelderpeton)(†)

　最近提出された系統図なので特に無尾類の分類群に対する日本語訳は殆ど決まっていないようです。原報には、現在までに記載されている現生種の約半数に当たる4060種の分類につき検討した結果に基づき、属までの系統図が掲載されています。
┌無足目(アシナシイモリ目)(Gymnophiona)
┤├プレシオフィオナ類(Plesiophiona)/オアシナシイモリ科(Rhinatrematidae)
│└シュードフィオナ類(Psedophiona)
│　├ヌメアシナシイモリ上科(Ichthyophoidea)
│　│├ケララアシナシイモリ科(Uraeothphlidae)
│　│└ヌメアシナシイモリ科(Ichthyophiidae)
│　└アシナシイモリ上科(Caecilioidea)
│　　├アフリカアシナシイモリ科(Scoleconorphidae)
│　　└アシナシイモリ科(Caecilidae)
│┌有尾目(サンショウウオ目)(Urodela)
││├不完全鰓類(Imperfectibranchia)
└┤│├オオサンショウウオ科(Cryptobranchidae)
　││└サンショウウオ科(Hynobiidae)
　│└┬サイレン科(Sirenidae)
　│　└シュードサウリア類(Pseudosauria)
　│　　├イモリ亜目(Salamandroidea)
　│　　│├トラフサンショウウオ科(Ambystomatidae)
　│　　│└イモリ科(Salamandridae)
　│　　└アンフューマ類(Amphiumoidea)
　│　　　├ホライモリ科(Proteidae)
　│　　　└┬オリンピックサンショウウオ科(Rhyacotritonidae)
　│　　　　├アンフューマ科(Amphiumidae)
　│　　　　└プレソドン科(Plethodontidae)
　└無尾目(カエル目)(Anura)
　　├アングスティコラ類(Angusticoela)
　　│├オガエル科(Ascaphidae)
　　│└ムカシガエル科(Leiopelmatidae)
　　└ヒドロバトラキア類(Hydrobatrachia)
　　　├メディオギリニア類(Mediogyrinia)
　　　└ジオバトラキア類(Geobatrachia)
　　　　├ドルシパラ亜目(Dorsipares)
　　　　│├メキシコジムグリガエル科(Rhinophrynidae)
　　　　│└コモリガエル科(Pipidae)
　　　　└レボギリニア亜目(Laevogyrinia)
　　　　　├アーケオサリエンティア類(Archaeosalientia)
　　　　　│├トウブスキアシガエル科(Scaphiopodidae)
　　　　　│└┬パセリガエル科(Pelodytidae)
　　　　　│　└コノハガエル科(Megophryidae)
　　　　　└ラノモルファ上科(Ranomorpha)
　　　　　　├ユウレイガエル科(Heleophrynidae)
　　　　　　└アキパレス類(Aquipares)
　　　　　　　└┬ゴンドワヌラ類(Gondwanura)
　　　　　　　　│├インドハナガエル科(Nasikabatrachidae)
　　　　　　　　│└セーシェルガエル科(Sooglossidae)
　　　　　　　　└スコプタヌラ類(Scoptanura)
　　　　　　　　　├ガストレクミア類(Gastrechmia)
　　　　　　　　　│├┬クチボソガエル科(Hemisotidae)
　　　　　　　　　││└フクラガエル科(Brevicipitidae)
　　　　　　　　　│└┬クサガエル科(Hyperoliidae)
　　　　　　　　　│　└サエズリガエル科(Arthroleptidae)
　　　　　　　　　├エコスタータ類(Ecostata)
　　　　　　　　　│└┬フィリノマンティス科(Phrynomeridae)
　　　　　　　　　│　└ヒメアマガエル科(Microhylidae)
　　　　　　　　　├パナウラ類(Pananura)
　　　　　　　　　│└┬アフリカアカガエル科(Ptychadenidae)
　　　　　　　　　│　└エカウダタ類(Ecaudata)
　　　　　　　　　│　　└┬オドントバトラクス科(Odontobatrachidae)
　　　　　　　　　│　　　├ドロガエル科(Phrynobatrachidae)
　　　　　　　　　│　　　└アカガエル上科(Ranoidea)
　　　　　　　　　│　　　　└┬ニクティバトリクス科(Nyctibatrachidae)
　　　　　　　　　│　　　　　├ラニクサルデ科(Ranixalidae)
　　　　　　　　　│　　　　　├ハナトガリガエル科(Ceratobatrachidae)
　　　　　　　　　│　　　　　├┬アカガエル科(Ranidae)
　　　　　　　　　│　　　　　│└アオガエル科(Rhacophoridae)
　　　　　　　　　│　　　　　└┬オクシドジガ科(Occidozygidae)
　　　　　　　　　│　　　　　　└ヌマガエル科(Dicroglossidae)
　　　　　　　　　└ファネラウラ類(Phaneranura)
　　　　　　　　　　├デプロシフォナ類(Diplosiphona)
　　　　　　　　　　│└┬ヘルメットガエル科(Calyptocephalellidae)
　　　　　　　　　　│　└カメガエル科(Myobatrachidae)
　　　　　　　　　　└バイナウラ類(Bainanura)
　　　　　　　　　　　├フォラヌラ類(Phoranura)
　　　　　　　　　　　│└┬アロモバテス科(Aromobatidae)
　　　　　　　　　　　│　└ヤドクガエル科(Dendrobatidae)
　　　　　　　　　　　└フィリアヌラ類(Phrynanura)
　　　　　　　　　　　　├ガイアヌラ類(Gaianura)
　　　　　　　　　　　　│└┬クウトマンティ科(Ceuthomantidae)
　　　　　　　　　　　　│　└コガネガエル科(Brachycephalidae)
　　　　　　　　　　　　├ツノアマガエル上科(Hemiphractiformia)
　　　　　　　　　　　　│└ツノアマガエル科(Hemiphractidae)
　　　　　　　　　　　　└ヒロバトラキア類(Hylobatrachia)
　　　　　　　　　　　　　└┬アマガエル上科(Hyloidea)
　　　　　　　　　　　　　　│└┬フィリノメデューサ科(Phyllomedusidae)
　　　　　　　　　　　　　　│　└アマガエル科(Hylidae)
　　　　　　　　　　　　　　├ユビナガガエル上科(Leptodactyloidea)
　　　　　　　　　　　　　　│└ユビナガガエル科(Leptodactylidae)
　　　　　　　　　　　　　　├アマガエルモドキ上科(Centrolenoidea)
　　　　　　　　　　　　　　│└┬スリナムヒメヒキガエル科(Allophrynidae)
　　　　　　　　　　　　　　│　└アマガエルモドキ科(Centrolenidae)
　　　　　　　　　　　　　　├ヒキガエル上科(Bufonoidea)
　　　　　　　　　　　　　　│└┬オドントフィリニス科(Odontophrynidae)
　　　　　　　　　　　　　　│　└ヒキガエル科(Bufonidae)
　　　　　　　　　　　　　　├ツノガエル上科(Ceratophryoidae)
　　　　　　　　　　　　　　│└ツノガエル科(Ceratophryidae)
　　　　　　　　　　　　　　└ミズガエル上科(Telmatobioidae)
　　　　　　　　　　　　　　　└┬ミズガエル科(Telmatobieidae)
　　　　　　　　　　　　　　　　└シクラムフィス科(Cycloramphidae)

　┌フタアシトカゲ科(Dibamidae)
┌┴ヤモリ下目(Gekkota)
┴カナヘビ超科(Lacertoidea)
　│┌スキンク超科(Scincoidea)
　└┤┌┬テイウス超科(Teioidea)
　　└┤└ミミズトカゲ類(Amphisbaenia)
　　　└有毒有鱗類(Toxicofera)
　　　　├┬モササウルス類(Mosasuria)(†)
　　　　│└ヘビ亜目(Serpentes)
　　　　│┌オオトカゲ下目(Aunguimorpha)
　　　　└┤┌ポリグリファノドン類(Polyglyphanodontia)(†)
　　　　　└┴イグアナ下目(Iguania)
　　　　　　　└┬端生歯類(Acrodonta)
　　　　　　　　└両面歯類(Pleurodonta)