イヌ、ネコ、クマなどから構成される食肉目(Canivora)は、絶滅した肉歯目(Creodonta)から分岐して、現生種は列脚亜目と鰭脚亜目に二分される(今泉,1991)と考えられてきましたが、現在では遺伝子を用いた解析の結果を踏まえて、系統図は大きく書き換えられています。その結果、肉歯目は多系であったことが明らかとなり、食肉目はネコ型亜目とイヌ型亜目に二分されています。
アシカ、アザラシ、セイウチからなる旧鰭脚亜目は、クマ科の姉妹群としてクマ下目の所属となり(Agnarsson et al.,2010)、肉食が主体のこの目の中で、植物食を特異的に発達させたパンダ類のうち、レッサーパンダはイヌ科の姉妹群となるレッサーパンダ科として独立科となり(Sato et al.,2012)、ジャイアントパンダはクマ科の基底部に位置付けられています(Peng et al.,2007)。
【現生生物の系統概要】【植物界の系統概要】【後世動物の系統概要】【化石種】
肉歯目(Creodonta) 現生広獣類 哺乳類
【食肉目(Canivora)の系統概要】Agnarsson et al.(2010)
ネコ型、イヌ型の２亜目が単系であることは広く認められている様です。この例でのレッサーパンダはイヌ下目の所属になっていますが、その後、Sato et al.(2012)ではクマ科目イタチ上科に移されています。
┌奇蹄目(Perissodactyla)：ウマ、サイ、バク
┴┬鱗甲目(Pholidota)：センザンコウ
└食肉目(Canivora)
│┌ネコ型亜目(Feliformia)
│││┌──────キノボリジャコウネコ科(Nandiniidae)
││└┤┌─────ジャコウネコ科(Viverridae)
││ └┤┌┬───オビリンサン科(Prionodontidae)
└┤ ││└┬──ハイエナ科(Hyaenidae)
│ └┤ └┬─マダガスカルマングース科(Eupleridae)
│ │ └─マングース科(Herpestidae)
│ └────ネコ科(Felidae)
└イヌ型亜目(Caniformia)
│┌イヌ下目(Cynoidea)
││└┬────レッサーパンダ科(Ailuridae)
└┤ └────イヌ科(Canidae)
└クマ下目(Arctoidea)
│ ┌───クマ科(Ursidae)
│┌┴鰭脚類(Pinnipedia)
└┤ │┌┬セイウチ科(Odobenidae)
│ └┤└アシカ科(Otariidae)
│ └─アザラシ科(Phocidae)
└イタチ上科(Musteloidea) → 【イタチ上科】
│┌───キンカジュー属 Potos
└┴┬─スカンク科(Mephitidae)
└┬アライグマ科(Procyonidae)
└イタチ科(Mustelidae)
┴┬鱗甲目(Pholidota)：センザンコウ
└食肉目(Canivora)
│┌ネコ型亜目(Feliformia)
│││┌──────キノボリジャコウネコ科(Nandiniidae)
││└┤┌─────ジャコウネコ科(Viverridae)
││ └┤┌┬───オビリンサン科(Prionodontidae)
└┤ ││└┬──ハイエナ科(Hyaenidae)
│ └┤ └┬─マダガスカルマングース科(Eupleridae)
│ │ └─マングース科(Herpestidae)
│ └────ネコ科(Felidae)
└イヌ型亜目(Caniformia)
│┌イヌ下目(Cynoidea)
││└┬────レッサーパンダ科(Ailuridae)
└┤ └────イヌ科(Canidae)
└クマ下目(Arctoidea)
│ ┌───クマ科(Ursidae)
│┌┴鰭脚類(Pinnipedia)
└┤ │┌┬セイウチ科(Odobenidae)
│ └┤└アシカ科(Otariidae)
│ └─アザラシ科(Phocidae)
└イタチ上科(Musteloidea) → 【イタチ上科】
│┌───キンカジュー属 Potos
└┴┬─スカンク科(Mephitidae)
└┬アライグマ科(Procyonidae)
└イタチ科(Mustelidae)
【イタチ上科(Musteloidea)の系統概要】Sato et al.(2012)
肉食が主体の食肉目の中で、植物食を特異的に発達させたパンダ類のうち、レッサーパンダはイヌ科の姉妹群となるレッサーパンダ科に、ジャイアントパンダはクマ科に配置されています。
┌イタチ科(Mustelidae)
││ ┌ゾリラ亜科(Ictonychinae)
││ ┌┤└┬グリソン族(Lyncodontini)
││ ┌┤│ └ゾリラ族(Ictonychini)
┌┤│ ┌┤│└カワウソ亜科(Lutrinae)
│││ ┌┤│└─イタチ亜科(Mustelinae)
┌┤││┌┤│└──イタチアナグマ亜科(Helictidinae)
│││└┤│└───クズリ亜科(Guloninae)
┤││ │└┬───ラーテル亜科(Mellivorinae)
│││ │ └───アナグマ亜科(Melinae)
│││ └─────アメリカアナグマ亜科(Taxidiinae)
││└アライグマ科(Procyonidae)
│└─レッサーパンダ科(Ailuridae)
└──スカンク科(Mephitidae)
││ ┌ゾリラ亜科(Ictonychinae)
││ ┌┤└┬グリソン族(Lyncodontini)
││ ┌┤│ └ゾリラ族(Ictonychini)
┌┤│ ┌┤│└カワウソ亜科(Lutrinae)
│││ ┌┤│└─イタチ亜科(Mustelinae)
┌┤││┌┤│└──イタチアナグマ亜科(Helictidinae)
│││└┤│└───クズリ亜科(Guloninae)
┤││ │└┬───ラーテル亜科(Mellivorinae)
│││ │ └───アナグマ亜科(Melinae)
│││ └─────アメリカアナグマ亜科(Taxidiinae)
││└アライグマ科(Procyonidae)
│└─レッサーパンダ科(Ailuridae)
└──スカンク科(Mephitidae)
【ジャイアントパンダ周辺の系統概要】Peng et al.(2007)
ミトコンドリアDNAの重鎖にある蛋白質の遺伝子配列を、近隣結合法(neighbor-joining)で解析した結果です。
┌クマ科(Ursidae) 
││ ┌ヒグマ Ursus arctos
┌┤│┌┴ホッキョクグマ Ursus maritimus
┌┤│└┴─マレーグマ Helarctos malayanus
││└───ジャイアントパンダ Ailuropoda melanoleuca
│└鰭脚類(Pinnipedia)
┌┤ │┌┬─ハイイロアザラシ Halichoerus grypus
││ └┤└─ゼニガタアザラシ Phoca vitulina
┌┤│ └┬─ニュージーランドアシカ Phocarctos hookeri
│││ └─トド Eumetopias jubatus
││└イタチ上科(Musteloidea)
┌┤│ │┌┬──アメリカテン Martes americana
│││ └┤└──レッサーパンダ Ailurus fulgens
┤││ └┬──アライグマ Procyon lotor
│││ └──シマスカンク Mephitis mephitis
││└──────イヌ Canis lupus familiaris
│└───────ネコ Felis silvestris catus
└鱗甲目(Pholidota)
└───────オナガセンザンコウ Phataginus tetradactyla
││ ┌ヒグマ Ursus arctos
┌┤│┌┴ホッキョクグマ Ursus maritimus
┌┤│└┴─マレーグマ Helarctos malayanus
││└───ジャイアントパンダ Ailuropoda melanoleuca
│└鰭脚類(Pinnipedia)
┌┤ │┌┬─ハイイロアザラシ Halichoerus grypus
││ └┤└─ゼニガタアザラシ Phoca vitulina
┌┤│ └┬─ニュージーランドアシカ Phocarctos hookeri
│││ └─トド Eumetopias jubatus
││└イタチ上科(Musteloidea)
┌┤│ │┌┬──アメリカテン Martes americana
│││ └┤└──レッサーパンダ Ailurus fulgens
┤││ └┬──アライグマ Procyon lotor
│││ └──シマスカンク Mephitis mephitis
││└──────イヌ Canis lupus familiaris
│└───────ネコ Felis silvestris catus
└鱗甲目(Pholidota)
└───────オナガセンザンコウ Phataginus tetradactyla
【文献】
今泉吉典監修 (1991) 食肉目 (世界の動物|分類と飼育2), 235p, どうぶつ社, 東京.
Agnarsson I, Kuntner M and May-Collado LJ (2010) Dogs, cats, and kin: A molecular species-level phylogeny of Carnivora, Mol Phylogen Eviol, 54, 726-745, DOI: 10.1016/j.ympev.2009.10.033, Accessed: 2026-02-01.
Sato JJ, Wolsan M, Prevosti FJ, D’Elía G, Begg C, Begg K, Hosoda T, Campbell KL and Suzuki H (2012) Evolutionary and biogeographic history of weasel-like carnivorans (Musteloidea), Mol Phylogen Evol, 63(3), 745-757, DOI: 10.1016/j.ympev.2012.02.025, Accessed: 2026-02-02
Peng R, Zeng B, Meng X, Yue B, Zhang Z, Zou F (2007) The complete mitochondrial genome and phylogenetic analysis of the giant panda (Ailuropoda melanoleuca), Gene 397, 76–83, DOI: 10.1016/j.gene.2007.04.009, Accessed: 2026-02-08
Bininda-Emonds (2004) Phylogenetic Position of the Giant Panda, In Giant Pandas: Biology and Conservation (Lindburg DG and Baragona K eds.), DOI: 10.1525/california/9780520238671.003.0002, Accessed: 2026-02-08